自動養殖污水處理設備的主要特征是有機物濃度高、懸浮物多、色度深，并含有大量的細菌，因含有大量動物的糞便而使NH3-N濃度很高。廢水中的固體殘渣主要為有機物質，如不進行有效固液分離，就會給后續處理帶來困難，增加處理負荷，影響處理效果。

3.微生物在污水中加入含有細菌、微生物的活性污泥，同時往污水中加入空氣，活性泥通過物理吸附、生物降解等方式來達到凈化污水的目的。也可使用生物膜法來處理污水，由生物濾池、生物轉盤、生物接觸氧化池及生物流化床等組成，工作原因是使污水通過一層表面充滿生物膜的濾料，通過大量微生物的降解氧化，來處理污水。